El 12 de marzo de 1940 se dictó el decreto 735 del Ministerio de Educación Pública, que daría vida al actual Museo Regional de la Araucanía como el Museo Araucano de Temuco dependiente de la Dirección de Bibliotecas Archivos y Museos. Se designó como primer Director Conservador al historiador Hugo Gunkel Luers.
Este Museo ocupó el segundo piso del Instituto San José -actual Colegio La Salle- por calle Claro Solar hasta 1952, fecha en se traslada al edificio de calle Bello 785, al llegar a Prat, funcionando hasta 1968. Entre 1969 y 1970 se traslada el Museo Regional a su actual edificio de Avenida Alemania 084. Este edificio fue construido en 1924 por la familia de Carlos Thiers Spielmans, adquirido por la Dirección de Bibliotecas, Archivos y Museos y declarado Monumento Nacional el 24 de marzo de 1997.